Mundo

Corpo humano é um terreno fértil para genes de resistência antimicrobiana, mostra novo estudo
A comunidade de micróbios que vivem em nossos corpos pode estar agindo como um reservatório de resistência a antibióticos, de acordo com uma nova pesquisa do Earlham Institute e do Quadram Institute em Norwich. O trabalho está publicado...
Por Instituto Earlham - 28/03/2023


Dois grupos distintos aparentes na paisagem global dos perfis de resistoma do intestino adulto. uma projeção NMDS de dissimilaridades de Bray-Curtis entre os perfis de família ARG transformados em log (cpg) em metagenomas intestinais adultos (contornos estimam densidades de amostra). As amostras foram coloridas por atribuição de agrupamento (PAM, agrupamento de Bray-Curtis, k=2). b Largura média da silhueta dos clusters PAM Bray-Curtis em função do número do cluster k. c Densidade amostral projetando pontos na linha que une os medoids do cluster usando dissimilaridades de Bray–Curtis. d Gráficos de caixa da abundância somada de ARGs em cada classe de antibióticos, separados por resistotipo ('background' ou 'FAMP') com a distribuição do total de ARGs (cpg) por resistotipo mostrado na parte inferior. e Abundâncias relativas das dez espécies com maior diferença média entre resistótipos e teste de Mann-Whitney bilateral, ajustado por Benjamini-Hochberg p < 0,05. As estatísticas sobre a abundância diferencial de classes ARG e as espécies entre os dois resistotipos são fornecidas na Tabela S7. Os resultados do agrupamento dos perfis ARG com métodos alternativos e agrupamento de composições de espécies são apresentados na Fig. S8. A comparação da diversidade de espécies e diversidade de ARG entre o fundo e os resistotipos FAMP é fornecida na Fig. S5. A nomenclatura do resistotipo FAMP reflete as cinco classes de resistência a antibióticos enriquecidas com as maiores diferenças: F, fluoroquinolona e fosfomicina; A, aminoglicosídeo; M, multidrogas; P, peptídeo. Número de amostras de metagenoma n = 3.034 para o resistotipo de fundo, n = 2.338 para o resistotipo FAMP. Nos gráficos de caixa, a caixa se estende dos percentis 25 a 75, a linha dentro da caixa é a mediana e o bigode se estende dos valores mínimos aos valores máximos. Crédito:Nature Communications (2023). DOI: 10.1038/s41467-023-36633-7

A comunidade de micróbios que vivem em nossos corpos pode estar agindo como um reservatório de resistência a antibióticos, de acordo com uma nova pesquisa do Earlham Institute e do Quadram Institute em Norwich. O trabalho está publicado na revista Nature Communications .

O uso de antibióticos leva a " danos colaterais " ao microbioma, aumentando o número de genes de resistência transmitidos entre as cepas no microbioma. As descobertas também sugerem que esses genes se espalham tão facilmente por uma população que, independentemente de sua própria saúde e hábitos, o número de genes de resistência em seu intestino é fortemente influenciado pelas tendências nacionais no consumo de antibióticos.

O aumento da resistência antimicrobiana (RAM) entre patógenos humanos é amplamente visto como uma das ameaças mais sérias à saúde global nas próximas décadas. Acredita-se que a RAM esteja contribuindo para dezenas de milhares de mortes na Europa a cada ano.

Rastrear o surgimento e a disseminação de genes que ajudam esses patógenos a ignorar os antibióticos geralmente se limita a amostras coletadas de indivíduos infectados. A maioria dos micróbios que vivem no corpo humano , no entanto, não são patogênicos.

O microbioma humano é uma comunidade complexa e dinâmica de milhões de espécies de micróbios, vivendo principalmente no intestino e coexistindo conosco. Os microbiomas desempenham um papel importante na saúde e na doença, sendo o microbioma intestinal conhecido por ajudar na digestão dos alimentos e no desenvolvimento do nosso sistema imunológico.

O professor Chris Quince, autor da pesquisa no Instituto Earlham e no Instituto Quadram, disse: "Mesmo um indivíduo saudável que não tomou antibióticos recentemente é constantemente bombardeado por micróbios de pessoas ou até mesmo de animais de estimação com os quais eles interagem, o que leva a que os genes de resistência se tornem embutidos em sua própria microbiota. Se eles existem em uma população com uma carga pesada de consumo de antibióticos, isso leva a mais genes de resistência em seu microbioma."

Para entender melhor o impacto dos antimicrobianos no microbioma intestinal, pesquisadores do Earlham Institute e do Quadram Institute em Norwich, juntamente com colaboradores da República da Coreia, analisaram mais de 3.000 amostras de microbioma intestinal, coletadas de indivíduos saudáveis ??em 14 países.

Eles então compararam os genes de resistência identificados nas amostras com os encontrados em grandes coleções de genomas, a fim de entender o movimento dos genes AMR entre espécies de micróbios e patógenos.

"Focamos deliberadamente em amostras de pessoas saudáveis, ou pelo menos aquelas que tínhamos certeza de que não estavam tomando antibióticos", explicou o professor Quince. “Precisávamos ver o perfil do gene no microbioma intestinal sem a influência de nenhum antimicrobiano”.

Eles catalogaram e registraram cuidadosamente o número de genes de resistência antimicrobiana encontrados nas amostras, comparando os dados com o banco de dados abrangente de resistência a antibióticos, um recurso de saúde pública onde os genes de resistência são documentados.

A equipe identificou uma média de 16 genes AMR por amostra de fezes analisada. Eles também descobriram que o número médio de genes variava entre os 14 países para os quais tinham dados. Por exemplo, eles observaram uma variação de cinco vezes nos níveis médios de resistência entre os mais baixos da Holanda e os mais altos da Espanha.

Usando dados da Organização Mundial da Saúde e do ResistanceMap, a equipe conseguiu mostrar uma forte correlação entre a frequência de genes de resistência presentes em um país e os níveis nacionais de consumo de antibióticos.

“Descobrimos que em países onde os antibióticos são tomados com mais regularidade, suas populações também têm um número maior de genes de resistência em seu microbioma intestinal ”, disse o professor Quince.

A razão pela qual esse dano colateral é um problema tão importante é que os micróbios estão constantemente compartilhando genes uns com os outros. Conhecido como transferência horizontal de genes , esse processo ajuda os genes AMR a se espalharem entre as espécies.

"Nossos corpos estão continuamente importando e exportando micróbios e cepas de patógenos", explicou o professor Quince. "Essas cepas estão passando genes de um lado para o outro, o que significa que o desafio da RAM deve ser enfrentado tanto no nível micro quanto no macro. Dada nossa complexa relação com os micróbios, precisamos fazer mais pesquisas para entender como maximizamos os benefícios e minimizar os riscos quando se trata de orientar as decisões de tratamento e desenvolver novos medicamentos."

O professor Falk Hildebrand, autor da pesquisa no Quadram Institute e no Earlham Institute, disse: "Sabemos há alguns anos que os genes de resistência antimicrobiana podem se espalhar incrivelmente rápido entre as bactérias intestinais. Este estudo é muito importante porque pode, pela primeira vez, quantificar o impacto que o uso nacional de antibióticos tem em nossas bactérias comensais, além de nos fornecer informações sobre os tipos comuns de resistência que podemos esperar que evoluam”.

Os pesquisadores planejam realizar mais pesquisas – e encorajar outros a fazê-lo – a fim de investigar a relação em mais países e informar estratégias de saúde pública.

As amostras estudadas vieram da Áustria, Canadá, China, Alemanha, Dinamarca, Espanha, França, Israel, Itália, Cazaquistão, Madagascar, Holanda, Suécia e Estados Unidos.


Mais informações: Kihyun Lee et al, Impactos em nível populacional do uso de antibióticos no microbioma intestinal humano, Nature Communications (2023). DOI: 10.1038/s41467-023-36633-7

Informações do jornal: Nature Communications 

 

.
.

Leia mais a seguir