Cientistas descobrem regras fundamentais sobre como o vírus da dengue infecta seus mosquitos e hospedeiros humanos
Infecções virais transmitidas por mosquitos, antes confinadas a regiões tropicais, estão se espalhando. O vírus da dengue infecta até 400 milhões de pessoas no mundo todo a cada ano...
A) Gráfico de rosca mostrando a porcentagem de uso relativo de códons sinônimos (RSCU) do vírus da dengue (DENV) e RSCU humano para códons de arginina. Os códons são rotulados com base na otimalidade humana (vermelho = ótimo, azul = não ótimo). B) A mudança de dobra RSCU foi usada como uma métrica para a preferência de códon do DENV em relação ao humano e foi calculada como a razão log2 de RSCU observada no DENV em comparação ao humano por códon sinônimo por aminoácido. Os códons que mostram uma mudança de dobra RSCU maior que 0,5 são códons preferidos do DENV (verde), códons com uma mudança de dobra RSCU menor que 0,5 são códons não preferidos do DENV (roxo). C) Gráfico de dispersão mostrando a mudança de dobra RSCU (em relação ao humano) para DENV2 e coeficiente de estabilidade de códon humano (CSC). R = -0,26, p = 0,045, correlação de classificação de Spearman. Crédito: bioRxiv (2023). DOI: 10.1101/2023.06.14.544804
Infecções virais transmitidas por mosquitos, antes confinadas a regiões tropicais, estão se espalhando. O vírus da dengue infecta até 400 milhões de pessoas no mundo todo a cada ano, de acordo com estimativas da Organização Mundial da Saúde, e não há tratamentos disponíveis para essa doença.
Agora, uma pesquisa do Instituto Stowers de Pesquisa Médica revelou estratégias surpreendentes sobre como a dengue e centenas de outros vírus se replicam em seus hospedeiros, com o potencial de auxiliar no desenvolvimento de novos tratamentos antivirais e vacinas.
Liderado pela pesquisadora de pré-doutorado da Stowers, Luciana Castellano, no laboratório do pesquisador associado Ariel Bazzini, Ph.D., o estudo, atualmente disponível no servidor de pré-impressão bioRxiv, aparece na Molecular Systems Biology nesta segundoa-feira (22). A pesquisa revela que o genoma do vírus da dengue usa códons menos eficientes, ou "vocabulário", para produzir suas próprias proteínas usando a maquinaria do hospedeiro para se replicar e se espalhar.
Um códon é uma sequência de três nucleotídeos, ou "palavras" no código genético que ajudam a fazer proteínas. Os pesquisadores descobriram que centenas de outros vírus também usam "palavras" em seu código genético que são menos eficientes em seus hospedeiros mosquitos e humanos.
"Agora que sabemos o que a dengue e outros vírus usam quando infectam nossas células, temos pistas de como podemos ajudar a prevenir essas doenças mortais", disse Bazzini.
"Durante a infecção, células hospedeiras e invasores virais estão em guerra", disse Castellano. "Assim como na construção de armas, tanto vírus quanto células precisam construir proteínas para lutar e se defender."
O vírus da dengue precisa das proteínas codificadas em seu genoma de RNA fita simples para se propagar, mas o vírus não pode produzi-las sozinho. O vírus deve usar a maquinaria de produção de proteína da célula hospedeira, então os pesquisadores levantaram a hipótese de que o vírus da dengue usaria códons ou "vocabulário" semelhante ao dos mosquitos e humanos.
"O código genético é universal para todos os organismos vivos e contém 64 códons, as 'palavras' de três nucleotídeos do RNA, que especificam os aminoácidos que compõem as proteínas", disse Bazzini.
A natureza do código genético permite que mais de um códon especifique o mesmo aminoácido. Funcionando como sinônimos na linguagem, códons que especificam o mesmo aminoácido são chamados códons sinônimos.
Mas assim como cada sinônimo é uma palavra distinta, cada códon sinônimo tem propriedades individuais que podem impactar a eficiência de uma célula para fabricar proteínas, bem como a estabilidade do RNA. Além disso, um códon sinônimo em particular pode ser eficiente e ótimo em uma espécie, mas ineficiente e não ótimo em outra.
Esse conceito é chamado de otimalidade de códon. O Bazzini Lab estuda o código de otimalidade de códon em humanos e outros vertebrados, e neste estudo, os pesquisadores identificaram pela primeira vez que o genoma do mosquito também segue seu próprio código de otimalidade.
Os pesquisadores descobriram que o vírus da dengue tende a usar códons sinônimos que são considerados menos ideais em seus hospedeiros mosquitos e humanos, ao contrário de sua previsão original.
"Ficamos surpresos ao descobrir que o vírus da dengue usa preferencialmente os códons menos eficientes do hospedeiro, possivelmente como uma estratégia para escapar de uma resposta antiviral do hospedeiro", disse Castellano.
"Os vírus acumulam mutações durante a infecção de seus hospedeiros. Ficamos surpresos ao descobrir que mutações no genoma do vírus da dengue em direção a esses códons menos eficientes aumentaram a aptidão do vírus da dengue em células de mosquitos e humanas ", disse Ryan McNamara, um analista de bioinformática no Bazzini Lab, cuja contribuição foi fundamental para este trabalho.
A equipe analisou centenas de outros vírus que infectam humanos e descobriu que muitos deles, incluindo HIV e SARS-CoV-2, usam preferencialmente códons menos eficientes em relação aos humanos, sugerindo que eles desenvolveram um genoma "ineficiente" como uma estratégia para usar recursos de células hospedeiras de uma forma que beneficie o vírus. A preferência conservada entre vírus tem implicações para entender não apenas como os vírus evoluem, mas também como a relação hospedeiro-patógeno muda ao longo do tempo.
"Fundamentalmente, este trabalho alterou a forma como pensamos sobre a relação entre um vírus e uma célula hospedeira", disse Bazzini.
"No futuro, esperamos entender melhor o mecanismo pelo qual os vírus estão se beneficiando do uso desses códons ineficientes e quais moléculas os vírus podem estar manipulando para ganhar controle", disse Castellano.
Os Centros de Controle e Prevenção de Doenças relataram que os casos de dengue dobraram desde o ano passado nas Américas e alertam para um risco aumentado de infecção nos EUA.
"À medida que os mosquitos estão se espalhando para regiões mais amplas e globais, precisamos começar a pensar muito seriamente em como combater a dengue e outras infecções virais transmitidas por mosquitos ", disse Bazzini.
Mais informações: Luciana A Castellano et al, O vírus da dengue usa preferencialmente códons não ótimos de humanos e mosquitos, bioRxiv (2023). DOI: 10.1101/2023.06.14.544804
Informações do periódico: Molecular Systems Biology , bioRxiv